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L'elettroforesi su gel di poliacrilammide

L'elettroforesi su gel di poliacrilammide (PAGE) è una tecnica usata per analizzare le proteine in base alla loro dimensione. È simile all'elettroforesi su gel di agarosio che viene usata per analizzare il DNA dopo aver eseguito la PCR. Tuttavia, prima di effettuare un'elettroforesi su gel bisogna preparare le proteine, che sono ripiegate in complesse strutture 3D. È quindi necessario denaturare la struttura 3D delle proteine e renderle lineari. Per farlo, si aggiunge il sodio dodecil solfato (SDS), un detergente che, denaturando le proteine, le districa rendendole lineari. L'SDS serve anche per caricare negativamente le proteine. Ecco perché questa tecnica è nota come SDS-PAGE.

Quando le proteine hanno assunto forma lineare e carica negativa, vengono caricate su un gel di poliacrilammide a cui viene applicata una carica elettrica. Le proteine caricate negativamente migrano attraverso il gel poroso di poliacrilammide verso il polo positivo, che si trova all'estremità del gel. Le proteine più lunghe si muovono più lentamente rispetto a quelle più corte; ciò permette di separare le proteine in base alla loro lunghezza usando l'elettroforesi su gel di poliacrilammide.

Nella parte superiore dell'immagine ci sono le proteine rivestite di SDS, visualizzate come stringhe nere aggrovigliate di varie dimensioni. Al di sotto, le proteine sono messe in un rettangolo blu con il segno meno in alto e il segno più in basso. Il rettangolo si chiama 'Gel di poliacrilammide reticolato con campo elettrico applicato' e la freccia che punta in basso accanto al rettangolo mostra la direzione di migrazione. L'ultima immagine in basso mostra lo stesso rettangolo con le molecole di grandi dimensioni in alto, di medie dimensioni al centro e di piccole dimensioni in basso.

Figura 1. Elettroforesi su gel di poliacrilammide.